دخلت معظم المنشآت في "مرحلة الربط والتكامل"، والتي تتطلب ربط أنظمة المحاسبة والفوترة في المنشأة مباشرة مع أنظمة هيئة الزكاة والضريبة والجمارك لإرسال الفواتير لحظياً بصيغ تقنية معتمدة (XML أو PDF/A-3).

توفر الهيئة نظام "الزكاة التقديرية" للمنشآت التي لا تملك قوائم مالية مدققة، حيث يتم احتساب الزكاة بناءً على معايير محددة تشمل حجم النشاط، الإيرادات، وعدد العمالة، وذلك لتسهيل الامتثال على أصحاب المشاريع الناشئة.

هي ضريبة بنسبة 5% تفرض على أي عملية نقل ملكية عقارية أو بيع، ويجب سدادها قبل إتمام عملية الإفراغ لدى كاتب العدل أو الموثق، وتستثنى منها بعض الحالات مثل الهبة للأقارب من الدرجة الأولى أو توزيع المواريث.

يكون التسجيل إلزامياً إذا تجاوزت قيمة التوريدات السنوية الخاضعة للضريبة مبلغ 375,000 ريال. ويكون اختيارياً إذا تجاوزت التوريدات 187,500 ريال، وهو ما يفضله البعض لاسترداد ضريبة المدخلات.

يمكن تقديم طلب "اعتراض" عبر بوابة الهيئة الإلكترونية خلال 60 يوماً من تاريخ إبلاغ المنشأة بالربط الزكوي أو الضريبي. وفي حال عدم الاقتناع بقرار الهيئة، يمكن التصعيد للأمانة العامة للجان الضريبية.

هي مبادرة تتيح للمستوردين الملتزمين فسح بضائعهم من المنافذ الجمركية خلال مدة قياسية (أقل من 24 ساعة) فور وصولها، وذلك من خلال التقديم المسبق للبيانات الجمركية والربط التقني مع أنظمة الهيئة.